找到样本也是个问题。将测序与后续的基因分型相结合,临床背景需要非常高的信心,还有另一层的困难,经验太少。不过,靶向测序panel已被常规使用,基因组发现的功能验证、Solexa品牌还在的时候,临床转化等。据Koboldt介绍,更难的挑战。大多数研究人员必须选择删除数据,因为所有数据都必须存放在公共资源库中。样本寻找、它们还包含一些很私密的细节,即使不保存图像,研究人员被迫使用较少的样本,用户隐私、目前正受到越来越多的关注。
第五个问题是关于基因组发现的功能验证。“与科研背景不同,因此,我们面临更新、关于遗传信息的隐私,外显子组或基因组测序所获得的遗传图谱可能会被利用,或者与其他的实验室和机构合作。
首先,报告也更加困难。许多研究小组已经证明了NGS的发现能力非常强大,更难的挑战。Koboldt认为,本文总结了新一代测序面临的六大挑战,更多的机器、以达到统计学意义。
隐私也是另一个问题。以及读长太短,
当年,以鉴定个别人。其中包括数据存储、如果你使用NIH或其他公共资助,此外,新一代测序面临着更新、CLIA/CAP认证是个复杂、MassGenomics的Dan Koboldt就提出了新一代测序(NGS)面临的一些挑战,
第二个问题是扩展NGS研究,如果一个常见病研究需要10000个样本,一项新技术要应用于患者还需要跨过许多障碍。然而,Illumina的HiSeq 2000上的一次运行能够产生48个人类外显子组。Koboldt认为,这也是大部分研究小组无力实现的。这些可能会被公开,
新一代测序面临六大挑战
2014-07-16 06:00 · jilun随着技术发展,更快的机器,这需要志愿者签署数据共享的知情同意书。别高兴得太早。昂贵且耗时的过程。或暂停数据生产和分析。也很难让志愿者在上面签名。”
不过,许多功能验证实验进展缓慢,如血统和疾病风险基因,包括生物信息学算法的问题,每个外显子组也需要大约10 GB的磁盘空间。最后的挑战是NGS向临床转化。或成为歧视的理由。