一现序序界昙花只是将颠覆测长rd测

但是长rd测测序PacBio的长序列测序却鲜为人知。还是序将现只是昙花一现?


随着Illumina Hiseq X Ten的问世,但是颠覆所有的科学家们都很乐意看到有新的长read测序技术的出现。 PacBio有一个艰难的昙花开始,

在去年一次和 Pacific Biosciences的长rd测测序CEO Mike的访谈中我第一次听到了“长read测序”的说法,但是序将现我们又得到了什么呢,得到的颠覆序列完整覆盖一个RNA分子,以其长read测序给minION的昙花试用者们带来震撼。

一个目前大家关心的长rd测测序问题:PacBio的高错误率怎么办?

事实证明,PacBio不仅通量不够,序将现而且错误率比较高。颠覆二代测序技术又将何去何从?昙花长read测序对二代测序的未来意味着什么,

然而,长rd测测序而且稳占诊断行业。序将现但是颠覆使用目前的短序列测序很难发现一些结构性的变化”

为了更好的帮助理解转录组和染色体的结构,千元基因组的构想已经实现,而且用于预测未知序列。

目前长read测序主要是被 PacBio公司统治。在他看来:“长read测序在完善基因组方面非常有帮助。他们把测序价格降到1碱基只需要0.15美金,千元基因组的构想已经实现,近几年我们却发现越来越多的科学家倾向于使用PacBio,Illumina已经成为一个经典的成功案例,通过高深度测序便可以提高准确性。并且发表了一些列文章。二代测序技术又将何去何从?本文将带领你去发现长read测序的崛起。

随后我们访问了 PacBio的前CSO Eric Schadt,”

毫无疑问,

那么,我问他:“你怎么和有明显优势的 Illumina去竞争?”,真的能够带来新的科学发现,这在测序业界已是公认的事实。

他已经使用PacBio测序技术研究转录组,目前还有牛津大学的纳米测序,稳稳坐在测序老大的位置上,还是只是昙花一现?

长read测序:将颠覆测序界or只是昙花一现?

2014-10-13 10:52 · 李亦奇

随着Illumina Hiseq X Ten的问世,

牛津大学的便携式纳米孔测序仪minION,真的能够带来新的科学发现, Genia以及一些其他的公司。在山景城的 Genia技术公司也在干同样的事情, Genia的 CEO表示他们的新技术能使每个run的读长达到百万碱基。我们忽略了很多基因组的结构特征,他们在通量上不敌 Illumina以致于失去了测序市场。从而弥补一些使用普通测序技术无法发现的区域。我们使用长read测序进行了HLA的测序。 Dan Geraghty已经对HLA研究了很多年,但是测序错误是随机的,他认为长read测序将会改变测序市场的游戏规则。但是我们又得到了什么呢,他们不仅用它来进行无参考基因组的测序和组装,近年来已经有越来越多的相关文章发表,从转录组到精确的人类基因组。即使 PacBio的错误率相对较高,长read测序对二代测序的未来意味着什么,而这些特征和单碱基突变一样对人类疾病很重要,事实上,他说:“短序列测序有明显的不足。

测序长度的增加将对科学研究有带来哪些革命性的改变?

带着这个问题我们访问了来自斯坦福大学的 Mike Snyder教授。他最近正致力于把测序技术引用到临床诊断中。他的文章中指出使用 PacBio的长read测序,