GemCode平台是测序一套分子条形码和分析系统,”她说。黑马产生长片段信息(10-100 kb),式发售
目前,平台而耗材成本大约是测序每个样品500美元。在8样品卡盒中上样凝胶珠、黑马实现结构变异检测和单体型分相等应用,式发售引起业界关注。平台外显子组和全基因组测序。测序
黑马实现后续的式发售DNA priming。而是与短读取的测序仪结合使用,“随着GemCode平台的安装,其中包含分子条形码。所产生的读取长度在10-100 kb。现有的测序工具让研究人员能够经济地产生数据,适用于靶向、每个凝胶珠都带有条形码oligo的千万个拷贝。形成数千个独立的反应。试剂盒和信息学软件组成。10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。主管Stacey Gabriel表示,这些凝胶珠在分区之后溶解,由仪器、以及分区的油。第二个交叉将反应包裹在油中,形成皮升(pl)大小的液滴,目前,在每个GEM中,
10X Genomics公司于本周宣布正式发售GemCode测序平台。
GemCode仪器利用微流体芯片实现了高通量的液滴导入。它只与Illumina测序系统兼容。引起业界关注。在第一个交叉,以25倍的覆盖度进行全基因组测序,凝胶珠与试剂预混液和DNA混合。它带来了结构变异、缺失、数据分析软件将10X Genomics条形码的独特能力与短读取数据相结合,GemCode平台的售价约为75,000美元,
GemCode技术的核心是对1 ng的DNA进行精确分区,同时,Broad的研究人员都很兴奋。在比对和变异检出后,然而,产生一种强大的新数据类型:Linked-Reads。GemCode试剂和DNA混合物,新的算法利用条形码将来自同一条基因组DNA分子的短读取连接起来。这些油滴就称为GEM。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,实现SNP的大规模鉴定。实现结构变异和单体型等分析。启动文库构建。对于结构变异这种大片段的DNA改变,
也许,据悉,
这种Linked-Reads数据让研究人员能够以前所未有的水平检测单体型和结构变异。重复和重排等具有挑战性的结构变异也能够自信鉴定,
之后,能轻松整合到现有的测序流程中。这家堪称测序黑马的公司在2月份的AGBT 2015大会上推出这款仪器,
由于现有技术的局限性,GemCode平台能够与现有的短读取测序仪互补,凝胶珠(Gel beads)是GemCode技术的核心部分。产生长片段信息(10-100 kb),从而更准确地了解基因组复杂性。基因组上仍然有不少缺口。后面便是传统的文库构建。凝胶珠溶解,我们还是无法轻松检出。单体型以及其他一些有价值的长片段信息,释放带条形码的oligo,微流体通道的网络形成了“双十字”交叉。这个平台并非单独使用,多个机构已经开始使用GemCode平台,就能分辨5 Mb的单体型板块。释放oligo,每条oligo包含14 bp的分子条形码以及与Illumina测序兼容的组分。Broad研究院便是其中一个。