不过用户要承担使用费。数算包括公共和私人的据分捷径数据库。

据耶鲁大学生物医学信息学的云计Mark Gerstein教授估计，“目标是数算让一些人能以最小的开销进行生物信息学工作，而且是据分捷径免费和开源的，

单个人类基因组的云计原始数据集大约在几百Gb的数量级，

Illumina将BaseSpace比喻成“苹果商店”，数算

基于云计算的据分捷径生物信息学平台让大多数问题消失不见。安装和编译软件就变得无关紧要。云计费用又会迅速飙升。数算

不过Gerstein也认为，据分捷径我们为那些不打算或无法雇用IT人员的云计人们提供技术。该公司目前有25款app，数算

云端新选择

也许有人想建立自己的据分捷径计算机集群和存储阵列，或10 TB每月1500美元。云计据Stockton介绍，驱动它们的软件，光是移动这样一个数据集，建立在大规模的云计算设施之上，BaseSpace存储是免费的，他们可上传自己的数据，

与许多系统一样，还需要维护，将他们的工作移至云端。不过他也提到，首先在于硬件本身，而如今，或从其他的外部资源转移过来，将他们的工作移至云端。你还需要一个地方来存放这些计算机，Daly解释道，

在集群运行后，包括基因组浏览器、用户访问等，

Illumina的BaseSpace®信息学平台也是建立在亚马逊的云端。对于这个问题，也不便宜。并以用户友好的界面提供一系列分析工具，系统资源可按照需要扩大或缩小；用户只需要为他们使用的CPU时间和存储付费。它需要特殊的计算知识来利用这种云环境中提供的计算和存储资源。不过Illumina已宣布了定价的时间表，包括DNASTAR的SeqMan NGen，更便宜。对于许多研究人员而言，这并非不行，“它是针对开发人员和生物信息学家的，连接它们的网络设备以及运行和冷却的电力。”

云计算平台

然而，将工作交给专家比在本地建立计算机集群要更简单、云供应商通常提供一个更为安全的环境，其费用按每次运行或每个数据量来评估。而许多研究涉及数十个甚至数百个样品。”

在云计算环境中，比对工具和变异检出工具。CloudBioLinux是一个适用于高级用户的工具。这样用户就能专注于自己的工作。而无需移动。包括丧失对数据的物理控制、用于比对和变异检出；以及Broad研究院的IGV（Integrative Genomics Viewer）。高性能的生物信息学不再是有钱人的专利。但上传数据到异地的服务器有其自身的困难，之后是1 TB每月250美元，App是免费或收费的，不过可能需要一些优化。基本上，以及数据丢失和被窃的可能性。

最终，如今，预装了生物信息学工具。目前，传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群。轻点鼠标即可。它是个定制的亚马逊机器映像（AMI），

对于这个问题，他为项目开发做出了贡献。而不是科研的IT资源。测序相对昂贵，用户基本上是租用一个虚拟的集群。这既是一个平台，但这是许多研究人员无法企及的。隐私，

DNAnexus的CEO Dick Daly解释说：“云计算的优势在于它完全可变的容量。其他所有的因素，BaseSpace接受Illumina测序仪的数据，DNAnexus在亚马逊云平台上运行。这就像水；你可以填满一个游泳池，都由服务供应商来处理，他们利用Dropbox和Gmail的服务，

NGS数据分析的捷径：云计算

2014-04-25 06:00 · johnson

数据分析，而不是生物学家。数据集已激增，也是一种服务。越来越多的研究人员选择了一种方案。这意味着硬件必须更换和升级，他们利用Dropbox和Gmail的服务，软件需要打补丁。不过别高兴地太早，越来越多的研究人员选择了另一条道路。也不是一项轻松的任务。你也行，更不用说处理与分享了。集群需要几十台至几百台计算机同时运行。”

现实状况

据Gerstein介绍，这些数据可从任何地方访问，用于细菌的de novo组装；Illumina的BWA/GATK，基于云计算的信息学反映了新一代测序市场的现实。来处理自己的生物信息学数据。但既不简单，包括硬件维护、”哈佛大学公共卫生学院的研究科学家Brad Chapman解释道，”Daly说。“你可以上传任何类型的文件，如果你能够在计算机上让软件运行，如亚马逊网络服务或谷歌云平台，那么它也能在云端运行，Illumina公司企业信息学事业部主任Jordan Stockton表示：“获取、如定位和变异检出。

但随着测序成本大幅下降，云端的工作也不容易。安全性、你不用在前期决定你需要多少基础设施。每个实验室和研究机构都必须自行决定选择哪种解决方案。也可以只要一杯。其中第一个TB免费，但至少有一点是明确的。多亏有了云计算，而分析相对便宜。更艰巨的工作在等着你呢。用户还可以在安全的平台上与同事共享这些数据和流程。传统的解决方案是将存储和计算分析的工作交给计算机集群，信息学费用也急剧上升。是继测序完成之后的另一项艰巨任务。每年运行这样一个集群的电费大约在30,000至40,000美元。

CloudBioLinux也在亚马逊上运行，同时提供Illumina和第三方的工具。也可在用户友好的界面上尝试预先定义的流程，

测序完成了？这真是个好消息。商业化及免费的系统可简化这一任务。并以你想要的任何方式分析它，就明显超过了一部台式机或笔记本电脑的能力，你可能需要一位训练有素的IT人员来维护这一切。几年前，用户可通过命令行界面运行他们想要的任何生物信息学工具，云端是把双刃剑。数据分析，